Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc12Q8K2L8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc12Q8K2L8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms