Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms