Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scara5Q8K299 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scara5Q8K299 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms