Protein–RNA interactions for Protein: Q8K214

Scmh1, Polycomb protein SCMH1, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scmh1Q8K214 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scmh1Q8K214 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms