Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700001C19RikQ8K168 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700001C19RikQ8K168 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms