Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pkn3Q8K045 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkn3Q8K045 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkn3Q8K045 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkn3Q8K045 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkn3Q8K045 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkn3Q8K045 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pkn3Q8K045 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms