Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms