Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trip10Q8CJ53 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms