Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LgsnQ8CIX8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms