Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cc2d2aQ8CFW7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cc2d2aQ8CFW7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms