Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms