Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fbxo48Q8CAT8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms