Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Col6a6Q8C6K9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Col6a6Q8C6K9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col6a6Q8C6K9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col6a6Q8C6K9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Col6a6Q8C6K9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col6a6Q8C6K9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col6a6Q8C6K9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col6a6Q8C6K9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Col6a6Q8C6K9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col6a6Q8C6K9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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