Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ska3Q8C263 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ska3Q8C263 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ska3Q8C263 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ska3Q8C263 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska3Q8C263 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms