Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Atg16l1Q8C0J2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg16l1Q8C0J2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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