Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FarsaQ8C0C7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FarsaQ8C0C7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms