Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp47Q8BY87 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms