Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Iffo1Q8BXL9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms