Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sall4Q8BX22 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sall4Q8BX22 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms