Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube3dQ8BX13 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ube3dQ8BX13 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ube3dQ8BX13 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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