Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtpaQ8BWP5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TtpaQ8BWP5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms