Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW22

Ss18l1, Calcium-responsive transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l1Q8BW22 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ss18l1Q8BW22 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ss18l1Q8BW22 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ss18l1Q8BW22 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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