Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Catsper4Q8BVN3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Catsper4Q8BVN3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms