Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zfp398Q8BV16 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms