Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PcgF3Q8BTQ0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PcgF3Q8BTQ0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms