Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gpc2Q8BKV1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gpc2Q8BKV1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms