Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rspo4Q8BJ73 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms