Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D130040H23RikQ8BII3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
D130040H23RikQ8BII3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
D130040H23RikQ8BII3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
D130040H23RikQ8BII3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D130040H23RikQ8BII3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
D130040H23RikQ8BII3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
D130040H23RikQ8BII3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D130040H23RikQ8BII3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D130040H23RikQ8BII3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D130040H23RikQ8BII3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
D130040H23RikQ8BII3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D130040H23RikQ8BII3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
D130040H23RikQ8BII3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D130040H23RikQ8BII3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
D130040H23RikQ8BII3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
D130040H23RikQ8BII3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
D130040H23RikQ8BII3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
D130040H23RikQ8BII3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D130040H23RikQ8BII3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms