Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Clrn3Q8BHH8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Clrn3Q8BHH8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clrn3Q8BHH8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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