Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Htatsf1Q8BGC0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Htatsf1Q8BGC0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Htatsf1Q8BGC0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms