Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Katnb1Q8BG40 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms