Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms