Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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Atg4cQ811C2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Atg4cQ811C2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4cQ811C2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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Atg4cQ811C2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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Atg4cQ811C2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Atg4cQ811C2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg4cQ811C2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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