Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc50Q810U5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc50Q810U5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms