Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kdm5bQ80Y84 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kdm5bQ80Y84 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms