Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ntf4Q80VU4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ntf4Q80VU4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms