Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aldh3b1Q80VQ0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aldh3b1Q80VQ0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aldh3b1Q80VQ0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aldh3b1Q80VQ0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aldh3b1Q80VQ0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Aldh3b1Q80VQ0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Aldh3b1Q80VQ0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aldh3b1Q80VQ0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aldh3b1Q80VQ0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aldh3b1Q80VQ0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aldh3b1Q80VQ0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aldh3b1Q80VQ0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aldh3b1Q80VQ0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aldh3b1Q80VQ0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aldh3b1Q80VQ0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aldh3b1Q80VQ0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aldh3b1Q80VQ0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Aldh3b1Q80VQ0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aldh3b1Q80VQ0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms