Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ttc29Q80VM3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ttc29Q80VM3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ttc29Q80VM3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ttc29Q80VM3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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