Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
NischQ80TM9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NischQ80TM9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NischQ80TM9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms