Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clec18aQ7TSQ1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clec18aQ7TSQ1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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