Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clec4b1Q7TS58 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms