Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPS0

Rps6ka6, Ribosomal protein S6 kinase alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka6Q7TPS0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps6ka6Q7TPS0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps6ka6Q7TPS0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps6ka6Q7TPS0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps6ka6Q7TPS0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka6Q7TPS0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka6Q7TPS0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka6Q7TPS0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka6Q7TPS0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka6Q7TPS0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka6Q7TPS0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka6Q7TPS0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka6Q7TPS0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka6Q7TPS0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka6Q7TPS0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps6ka6Q7TPS0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms