Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Actn1Q7TPR4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Actn1Q7TPR4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms