Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ShprhQ7TPQ3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ShprhQ7TPQ3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms