Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU7

Letm2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm2Q7TNU7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Letm2Q7TNU7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Letm2Q7TNU7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms