Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zfp397Q7TNK4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp397Q7TNK4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms