Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tigd3Q7TM95 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms