Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScocQ78YZ6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ScocQ78YZ6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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