Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vma21Q78T54 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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