Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snd1Q78PY7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snd1Q78PY7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms